MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 2646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	CGG	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014534	ATCTTT	2	12	89	100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014534	TAAT	2	8	261	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014534	TAAC	2	8	278	285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014534	TTG	2	6	294	299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014534	A	6	6	475	480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014534	CTCA	2	8	503	510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014534	CTTTAT	2	12	558	569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014534	TAAA	2	8	571	578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014534	GATAAG	2	12	582	593	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014534	TCACG	2	10	595	604	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014534	T	6	6	614	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014534	TG	3	6	641	646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014534	T	6	6	654	659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014534	ATT	2	6	661	666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014534	T	8	8	680	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014534	CAG	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014534	GTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014534	CTT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014534	TTA	2	6	947	952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014534	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014534	GGCT	2	8	1054	1061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014534	A	6	6	1084	1089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014534	AACC	2	8	1103	1110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014534	TAAT	2	8	1125	1132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014534	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014534	TAC	2	6	1163	1168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014534	AATT	2	8	1217	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014534	CATT	2	8	1249	1256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014534	TGC	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014534	CTA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014534	ACC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014534	GATA	2	8	1587	1594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014534	TGA	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014534	TCA	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014534	CTA	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014534	TCA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014534	A	6	6	1687	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014534	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014534	A	6	6	1762	1767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014534	TGG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014534	GAT	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014534	AGGG	2	8	1964	1971	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014534	GCT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014534	TGC	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014534	TGAAGA	2	12	2061	2072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014534	CAA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014534	GAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014534	A	6	6	2110	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014534	ACCGC	2	10	2132	2141	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014534	GAT	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014534	CGC	2	6	2271	2276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014534	ATCCG	2	10	2286	2295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014534	GTT	2	6	2335	2340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014534	GCC	2	6	2390	2395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014534	GCACTC	2	12	2445	2456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014534	GTG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014534	GGAG	2	8	2550	2557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014534	T	6	6	2628	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014534	G	6	6	2650	2655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014534	CGT	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014534	TCAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014534	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014534	CGG	2	6	2808	2813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014534	ATC	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014534	GTC	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014534	GTC	3	9	2970	2978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014534	CCG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014534	TTTG	2	8	3225	3232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014534	CTACAG	2	12	3351	3362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014534	CGT	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014534	GT	3	6	3416	3421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014534	T	6	6	3470	3475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014534	AAT	2	6	3517	3522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014534	AAT	3	9	3587	3595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014534	TGA	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014534	ACC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014534	A	7	7	3696	3702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014534	GAT	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014534	A	6	6	3758	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014534	CAC	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014534	CA	3	6	3843	3848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014534	CA	3	6	3875	3880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014534	TCA	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014534	GAA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014534	TCC	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014534	AGA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014534	GAC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014534	CTC	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014534	GCT	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014534	ATT	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014534	TC	3	6	4250	4255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014534	CAAA	2	8	4330	4337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014534	TGC	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014534	AATA	2	8	4383	4390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014534	T	6	6	4429	4434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014534	GATT	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014534	ATT	2	6	5115	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014534	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014534	ATTG	2	8	5141	5148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014534	CCTT	2	8	5221	5228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014534	T	6	6	7805	7810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014534	GTT	2	6	7843	7848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014534	TAA	2	6	7871	7876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014534	GTC	2	6	7880	7885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014534	T	6	6	7889	7894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014534	TTG	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014534	GTC	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014534	AATCA	2	10	9105	9114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014534	CCA	2	6	9125	9130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014534	AACCCG	2	12	9156	9167	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014534	GAT	2	6	9203	9208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014534	TGC	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014534	GAT	2	6	9296	9301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014534	TTA	2	6	9346	9351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014534	G	6	6	9449	9454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014534	TTA	2	6	9588	9593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014534	ACT	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014534	GTC	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014534	AGGT	2	8	9649	9656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014534	TCA	2	6	9696	9701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014534	TTC	2	6	9704	9709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014534	CTC	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014534	TAG	2	6	9728	9733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014534	GAA	2	6	9751	9756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014534	TTAT	2	8	9853	9860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014534	CTTCC	2	10	9911	9920	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014534	CGA	2	6	9954	9959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014534	CTC	2	6	10016	10021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014534	ATT	2	6	10027	10032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014534	ATG	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014534	A	7	7	10137	10143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014534	TGA	2	6	10155	10160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014534	T	6	6	10173	10178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014534	CAA	2	6	10210	10215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014534	CTC	2	6	10235	10240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014534	CTC	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014534	TCTT	2	8	10362	10369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014534	AGA	2	6	10377	10382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014534	TGGT	2	8	10389	10396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014534	CTT	3	9	10499	10507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014534	T	6	6	10506	10511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014534	T	6	6	10568	10573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014534	GAA	2	6	10583	10588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014534	AG	3	6	10755	10760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014534	CGTT	2	8	10772	10779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014534	TAA	2	6	10803	10808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014534	T	6	6	10847	10852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014534	T	6	6	11541	11546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014534	TTAT	2	8	11576	11583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014534	GAAA	2	8	11599	11606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014534	GCC	2	6	11636	11641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014534	CA	3	6	12228	12233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014534	T	6	6	15661	15666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014534	ATTT	2	8	15721	15728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014534	G	6	6	15741	15746	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014534	T	7	7	15748	15754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014534	TAC	2	6	15759	15764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_014534	AAT	2	6	17920	17925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014534	GTA	2	6	18035	18040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014534	TAC	2	6	18063	18068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_014534	TCC	2	6	19827	19832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_014534	T	6	6	19874	19879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014534	ATT	2	6	19880	19885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014534	T	8	8	19927	19934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014534	AAT	2	6	19936	19941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_014534	T	6	6	19985	19990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014534	T	6	6	20032	20037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014534	T	6	6	20144	20149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014534	AAG	2	6	20150	20155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_014534	TTC	2	6	20315	20320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_014534	T	6	6	23749	23754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_014534	T	6	6	34225	34230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_014534	TAA	2	6	34786	34791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014534	TATT	2	8	34814	34821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014534	T	6	6	35185	35190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014534	T	6	6	35233	35238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_014534	A	6	6	86317	86322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014534	ATT	3	9	86400	86408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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